En 2009 el resultado de un proyecto menor apoyado por el Comité para el Desarrollo de la Investigación (CODI) de la Universidad de Antioquia fue publicado en el American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, ("Prevalence of Leptospira spp. In Urban Rodents from to Groceries Trade Center of Medellín, Colombia», Piedad Agudelo-Flórez, Andrés F. Londoño, Víctor H. Quiroz, Juan C. Ángel, Natalí Moreno, Erica T. Loaiza, Luis F. Muñoz, and Juan D. Rodas, Am. J. Trop. Med. Hyg., 81(5), 2009, pp. 906-910), y los últimos años la línea de investigación finalizó un proyecto de 3 años aprobado por Colciencias («Búsqueda de evidencias serológicas y genéticas de agentes emergentes y reemergentes en humanos y roedores en zonas urbanas y rurales de Antioquia, Colombia, código 111534319203»), que permitió obtener las primeras evidencias genéticas de agentes emergentes y reemergentes en roedores urbanos y rurales de tres regiones del norte del departamento de Antioquia, Colombia. Los resultados de este estudio representaron una laureada tesis de maestría que fue presentada en varios eventos nacionales e internacionales y fue publicada en 2011 (Londoño AF et al, Genetic Evidence of Hantavirus Infections in Wild Rodents from Northwestern Colombia, 2011. Vector Borne Zoonotic Dis, 11 (6): 701-708). Precisamente, a partir de los logros de este último estudio, con la detección de secuencias genéticas de un Hantavirus a partir de muestras de tejido de roedores silvestres en el corregimiento de Las Chagas en Necoclí, Antioquia, en el 2011 la línea obtiene un nuevo apoyo para formar un nuevo estudiante de doctorado con el proyecto: «Aislamiento, caracterización y análisis epidemiológico de un hantavirus detectado en Necoclí, Colombia» (código 20113600114763), y la asesoría de la Dra. Silvana Levis, del Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas (INEVH), Pergamino, Argentina, y del Dr. Charles Fulhorst de la University of Texas Medical Branch, UTMB.
También en el 2009, la línea de investigación de zoonosis emergentes y reemergentes obtuvo financiación de Colciencias para desarrollar el proyecto «Estudio ecológico de la endemicidad por Rickettsia en Colombia» (Cód: 111549326228), con el apoyo de los asesores nacionales Marylin Hidalgo de la Pontificia Universidad Javeriana y Salim Mattar de la Universidad de Córdoba, y de los asesores internacionales Gustavo Valbuena de la UTMB, y Marcelo Labruna de la Universidad de Sao Paulo, y la participación de un estudiante de doctorado de la UdeA y dos estudiantes de maestría, uno de la UdeA y el segundo de la Universidad de Córdoba. Todo ello, con el fin de estar preparados para futuros brotes similares a los ocurridos en los pasados años (2006, 2007 y 2008) en estas regiones. Al mismo tiempo se persigue desarrollar la infraestructura que mejore el conocimiento de estas enfermedades olvidadas en nuestro país. Como resultado de los dos primeros años en estos trabajos, se desarrolló un nuevo estudio basado en programas de Sistemas de Información Geográfica (SIG), con el fin de identificar áreas geográficas de riesgo y modelar y predecir la posibilidad de futuras áreas de brotes e investigaciones prometedoras.
La línea también ha llevado a cabo estudios sobre la infección por Ehrlichia y Rickettsia en perros de hospitales veterinarios urbanos (financiado por Colciencias), y en la verificación del estado de infección por Rickettsia de caballos de una planta de beneficio del municipio de Rionegro, Antioquia (apoyado por el CODI, UdeA), con el fin de determinar el probable papel de estas dos especies como centinelas de la infección humana. En estas dos becas participaron dos estudiantes de doctorado, ellos trabajaron en el desarrollo de una línea base de investigación para futuras ideas.
